質問: 字数制限の超過を考慮してほしい

まずは、単語数／文字数を減らす努力をしてみることを提案します。現状では制限字数より12000字多いということですが、これはかなり大幅な超過といえます。ジャーナルがこれだけの超過を認めるには、紙面上の余裕がないかもしれません。著者向けのガイドラインに「文字制限を超過する論文も考慮する」と書かれていても、どの程度の超過かは重視されるはずです。また、ある程度しか字数を削ることができなくても、編集者には努力の跡が分かるはずです。できるだけ字数を減らした後で、「できる限りの努力をしたが、これ以上減らすと論文の質に影響が出る」と編集者に伝えましょう。その上で、編集者に文字数超過を考慮してもらいたいと頼んでみるとよいでしょう。